1966年“文化大革命”开始，供销合作社受到冲击。供销合作社的方针和原则被否定，一些长期坚持行之有效的基本制度被取消，从事供销、商业工作的老干部被批判，县以上各级供销合作社管理机构相继瘫痪。但是由于广大职工抵制“文化大革命”运动的冲击，坚守工作岗位，商品零售额和利润仍有所增加。1970年，各级供销合作社再次并入同级商业局。
   1975年9月，省供销合作社从省商业局迁出，下设省土产果品公司、茶叶畜产公司、日杂回收公司、棉麻烟公司、农业生产资料公司。陆续恢复各地、市、供销合作社。全国供销合作总社提出供销社的基本任务是:领导农村市场，促进农副产品生产发展，组织工农业产品交换等。但是，由于“左”的思想影响，供销合作社的全民所有制性质未改变，合作社的特点和作用也未得到应有的发挥。特别是1976年，又经历了一场“反击右倾翻案风”，使供销社工作一度陷入混乱。由于“文化大革命”的影响，商品流通渠道堵塞，农村副业生产遭到严重破坏，货源不足，市场供应紧张。
尽管困难重重，但在各级供销社广大干部职工的共同努力下，商品购销业务和扶持社队发展农副业生产仍有成效。据1976年统计,全省共发放扶持生产资金339万元，帮助社队发展漆树、棕树、果树 617万株，养蜂1. 8万群，养山羊、绵羊、长毛兔204万只。1977年，各地供销社根据“面向生产、支援生产、参与生产、促进生产”的要求，又发放扶持生产资金284万元，帮助社队发展种植、养殖业等副业生产。至1980年，全省建立商品生产基地县43个， 其中年产5万张山羊板皮县18个、1万担蚕茧县2个、1. 5万担表芯纸县1个、50万条芦席县2个、10万盆“三花”(茉莉、珠兰、玉兰花)县1个，以及黄花菜、黑瓜籽、柑桔、山核桃、苹果、生漆等商品生产基地。随着农副产品生产的恢复和发展，供销社的购销业务扩大，市场供应的紧张局面渐趋缓解。